Внутри страны South African Airways (SAA) осуществляет более 600 рейсов в неделю, связывающих все крупные города (в стране более двух сотен ВПП), а также многие столицы африканского континента. Уровень технического состояния самолетов компании считается лучшим на континенте, а сервис соответствует международным нормам ИКАО. Полет на рейсовом самолете внутри страны довольно дорог, но обслуживание отличное и график движения соблюдается безукоризненно.
В последние годы внутреннее сообщение в ЮАР заметно расширились в связи с приходом новых авиакомпаний, часть из которых можно отнести к категории "лоукост":
FlyMango (www.flymango.com) летает между городами Йоханнесбург, Кейптаун, Дубран, Блюмфонтайн.
Kulula Air (www.kulula-air.com) летает между городами Йоханнесбург, Джордж, Кейптаун и Дурбан. Плюс региональные международные рейсы в Хараре (Зимбабве), Виндхук (Намибия), Лусака (Замбия) и Маврикий.
1time Aero (www.1time.aero) летает между Йоханнесбургом, Кейптауном, Порт-Элизабет, Дурбан, Ист-Лондон и Занзибаром (Танзания).
Interlink Airlines (www.interlinkairlines.com), связывает Йоханнесбург с Кейптауном, Дубраном, Парком Крюгер (Nelspruit), а так же с соседними государствами Мозамбик, Зимбабве и Танзания.
Тарифы на авиаперелеты по ЮАР относительно высоки, причем даже на упомянутых выше лоукостах. Средняя цена перелета по ЮАР редко опускается ниже $60-70 в одну сторону. Акции не часты, но даже их тарифы всегда на порядок выше, чем в Европе.